Грейнджер Рашид Башир, профессор биоинженерии и декан инженерного колледжа, возглавивший команду исследователей, которые в рамках проекта разработали новую технологию, которая позволяет быстро и с высокой точностью обнаруживать устойчивые к множественным лекарственным препаратам бактерии и другие патогены в низких концентрациях. Данное исследование было опубликовано и описано в статье PNAS, одном из самых цитируемых и всеобъемлющих междисциплинарных научных журналов в мире.
Исследователями был разработан тест на основе CRISPR, выявляющий низкий уровень генетического материала патогена в крови. Для этого не требуется амплификация нуклеиновых кислот. В диагностических тестах на основе CRISPR/Cas направляющие РНК связываются с ДНК или РНК патогена, запуская ферменты Cas, которые становятся активными и расщепляют репортерные нуклеиновые кислоты, флуоресцирующие при расщеплении. Однако метод на основе CRISPR не позволяет обнаруживать патогены на низких уровнях без предварительной амплификации.
Команда Башира создала диагностический тест на основе CRISPR, который позволяет обойти этап амплификации, объединив два блока CRISPR/Cas в комплекс под названием CRISPR-Cascade. Один блок содержит направляющую РНК, специфичную для нуклеиновой кислоты патогена, и белок Cas. Когда Cas расщепляет специально сконструированные нуклеиновые кислоты, которые добавляются в систему, части нуклеиновых кислот могут свободно связываться и активировать второй блок CRISPR/Cas, запуская цикл положительной обратной связи, который приводит к высокому соотношению сигнал/шум.
«Наши результаты показывают, что CRISPR-каскадный анализ обеспечивает высокочувствительное и специфичное молекулярное обнаружение, открывая возможности для передовых применений в диагностике на месте оказания медицинской помощи и за ее пределами» — говорят исследователи.
Читать больше новостей и статей о медицине можно здесь: https://madmed.media/