Как следует из таблицы 4 “Основные виды РНК”
основных видов рибосомных РНК существует 6 (5S, 5,8S, 16S, 23S, 18S, 28S). Чем они отличаются друг от друга и в чем они схожи и каковы их функции.
Для изучения органелл в клетках используется метод ультрацентрифугирования (седиментационный анализ). Он заключается в том, что в растворе с различными частицами при воздействии сил гравитации или центробежных сил происходит осаждение этих частиц с различной скоростью. Вот что говорится по этому поводу в книге:
“В этом методе скорость седиментации (осаждения) определяется размером и формой разделяемых компонентов и выражается коэффициентом седиментации S. Коэффициент седиментации измеряется в секундах и определяется по формуле: (с1х/с11)/и/х,” (Стр. 15).
Это значит, что на стенку центрифуги сразу оседают частицы с большим коэффициентом седиментации, на эти частицы оседают частицы с меньшим коэффициентом седиментации и так далее. Таким образом, получим слоенный осадок, примерно, такого порядка 5S, 5,8S, 16S, 23S, 18S, 28S. Вроде бы надо в этом ряду поменять местами частицы 23S и 18S, но я не знаю, как на скорость оседания (седиментации) влияют размер частицы или, как влияют ее формы.
В любом случае этот метод, дифференцирует частицы по размерам и форме, но он ничего не говорит об устройстве этих частиц. Из этих частиц ученые пытаются строить клеточные органеллы, которые должны выполнять те или иные функции в клетке. Часть функций выполняют известные молекулы: ДНК хранит информацию о строении живого, матричная РНК переносит эту информацию в белковую форму. Нам известны химические формулы этих молекул. Мы можем частично синтезировать эти молекулы. А что это за формулы рибосомных РНК? Например, вот это:
Это структура 16S рРНК E-coli. Чего здесь больше ДНК или РНК? Ветви с ДНК больше нежели петли и кольца с РНК. Ну это еще полбеды. Я даже могу допустить, что такую структуру могли ученые обнаружить в клетке. Но откуда она могла появиться в клетке? Может ли она быть транскрибирована с каких-нибудь участков ДНК или с каких-нибудь элементов митохондрии? Полагаю, что такой процесс не возможен. Может ли такая структура передаться по наследству и затем реплицироваться сама, распространяясь по клеткам? Похоже, что и это невозможно. В яйцеклетках, в зиготе, в моруле, да и в любой стволовой клетке такую структуру найти невозможно.
Да, но ведь ученые нашли эту органеллу в клетке – скажете вы. Нашли. Но нашли в соматической клетке, то есть в той клетке, в которой осуществлялся через транскрипцию синтез белка и не один раз. А куда девались мРНК, на которых синтезировались белки? Некоторые из этих мРНК довольно длинные и после отсоединения от них белковых молекул они не торопятся разложится на рибозу и основания. Они под воздействием различных излучений в клетке как распадаются на различные фрагменты, так и образуют различные связи с соответствующими элементами клетки и самими фрагментами, образуя глобулы вплоть до третичных структур. Это просто обычный мусор для клетки, который и губит ее в конце концов. Если клетки синтезируют одни и тот же вид белков, то и мусор в них примерно один и тот же. На участках с рибозой могут происходить соединения с транспортными РНК, образуя какие-нибудь фрагменты белков. Нельзя в этом отказывать и фрагментам ДНК, о чем речь будет идти дальше.
Но и эти глобулы могут образовывать между собой соответствующие соединения, в частности субчастицы 30 – 40S- и 50 — 60S, из которых появляется рибосома.
Рибосомная РНК в учебнике определяется так:
“Высокомолекулярные рибосомные РНК (рРНК) являются структурной основой для формирования рибонуклепротеинового тяжа, который, складываясь в пространстве, дает начало 30 – 40S- и 50 — 60S-субчастицам рибосомы; рРНК взаимодействуют с мРНК и аминоацил-тРНК в процессе трансляции. Низкомолекулярная 5SрРНК в комплексе с рибосомными белками формирует комплекс, который называют третьей субчастицей рибосомы, где 5SрРНК выступает в роли посредника между пептидилтрансферазным центром и ЕF-G-связывающими доменами. (Стр. 106-108).
Вот это все, что вы можете узнать из этой главы о рибосомных РНК.