Совет по разведению молочного скота (CDCB) с февраля начал внедрение нового метода, так называемых «сконструированных идентификаторов», который поможет восполнить пробелы в родословных животных и провести более точную генетическую оценку, передает The DairyNews со ссылкой на сайт Council On Dairy Cattle Breeding.
Знание происхождения животного и его родословной на несколько поколений назад, безусловно, важно для тех, кто работает над разведением продуктивного молочного скота. Тем не менее, нередко встречаются случаи, когда в родословной животных есть пробелы.
Если у животных есть такой пробел со стороны отца или матери, оценка их генетической ценности будет недостаточно полной. В этом случае специалисты заходят в тупик, будучи не в силах точно оценить вклад предков в генетические достоинства животного. А значит, не в состоянии рассматривать родословные целиком и принимать эффективные решения.
Чтобы заполнить пробелы в родословных, Совет по разведению молочного скота (CDCB) внедряет новое решение. Специалисты отмечают, что этот метод, «сконструированные идентификаторы», позволит создать более полную родословную для животных, у которых были утрачены связи по материнской линии. В результате генетические оценки животных будут более точными и надежными, что позволит увеличить точность оценок в США в целом.
Многие пробелы в родословных были заполнены за последнее десятилетие с развитием генотипирования и использованием геномики для определения происхождения. Отцовские предки часто легко обнаруживаются или подтверждаются с помощью геномных инструментов, потому что большинство производителей генотипированы.
Неизвестных предков по материнской линии — матерей и MGD (Material grand dams) — идентифицировать труднее, потому что они, вероятнее всего, генотипированы не были. Однако отсутствующие предки мужского пола по материнской линии могут быть обнаружены и добавлены в родословные. Поскольку большинство быков молочных пород в течение нескольких поколений были генотипированы, сопоставление гаплотипов может точно подтвердить, скорректировать или обнаружить данные при определении материнских предков, прародителей и даже более отдаленных предков с высокой точностью.
С учетом того, как выстроена современная система оценки в США, получение такой специфической информации очень важно, в то время как сопоставление гаплотипов позволяет нам идентифицировать MGS и прадедушку по материнской линии (MGGS).
Генетики из Лаборатории геномики и улучшения животных Министерства сельского хозяйства США, исследовательского партнера CDCB, разработали проверенный, высокоточный, рецензируемый метод для установления связи генотипированных животных с их обнаруженными предками. CDCB создаст Сконструированные идентификаторы с единственной целью: связать животных с их предками по материнской линии и другими предками, обнаруженными с помощью генотипирования и сопоставления гаплотипов. Эту же методологию можно применить для создания сконструированного идентификатора MGD при обнаружении пра-праотца по материнской линии (MGGS).
По мере регистрации этой дополнительной информации о родословной для животных, у которых информация о предках была недостаточной, будут рассчитываться более точные генетические оценки.
Начиная с 14 февраля 2023 г., сконструированные идентификаторы будут включаться в родословные генотипированных животных, у которых были обнаружены MGS или MGGS. После добавления информации о происхождении последующие ежемесячные и трехгодичные оценки будут становиться более точными и надежными. Постепенно в течение следующих нескольких месяцев у более чем миллиона генотипированных животных будет добавлена дополнительная информация о родословной, что приведет к более точным генетическим оценкам в США.
Как будут отображаться сконструированные идентификаторы?
- Чтобы быть эффективными, сконструированные идентификаторы должны быть уникальными, отслеживаемыми, стабильными и распознаваемыми.
- Уникальны для родословной, поскольку их цель — связать исходных животных с их предками.
- Прослеживаемыми и связанными с исходным животным, от которых они были получены (и страной происхождения животного)
- Стабильными, постоянно связывающими сконструированный идентификатор и исходное животное — если не будет найден истинный предок.
- Распознаваемыми: сконструированный идентификатор не может быть спутан с ID истинного предка.
Примеры сконструированных идентификаторов матери и MGD для животного американского происхождения показаны ниже. Для дальнейшего распознавания имена выявленных предков будут «Мать [ID исходного животного]» или «MGD [ID исходного животного]».
Для животных международного происхождения есть два отличия:
- 3-буквенный код породы вместо 2-х
- Пол (Ж или М) после кода страны
То, как сконструированные идентификаторы будут представлены в отчетах и документах, будет оставаться на усмотрение ассоциаций пород, центров обработки и других лиц, производящих эти записи.
Как сконструированные идентификаторы повлияют на оценки? Быки обычно имеют полные родословные, поэтому воздействие на информацию по ним будет очень ограниченным.
Животные с добавленными или обнаруженными предками в родословных получат более точные средние значения родителей по сравнению с тем, когда использовалась неизвестная родительская группа. Более точные средние значения, в свою очередь, повлияют на генетическую оценку животного.
Геномная технология для определения отцовства уже более десяти лет используется CDCB и командой USDA AGIL, которые были пионерами в улучшении генетического потенциала КРС через геномику.
Внедрение сконструированных идентификаторов (Constructed ID) просто позволяет CDCB связать эту хорошо проверенную технологию с родословными животных и избежать «темных пятен» в родословных, связанных с недостаточной информацией о предках. Сконструированные идентификаторы — новый способ использования геномных технологий, постоянного повышения точности генетических оценок в США и предоставления более полной информации о родословной производителям, когда те принимают решения об осеменении и управлении стадом.