Скачиваем новый релиз с оф.сайта releases.1c.ru, в моём случае 64-битную версию
Cервер 1С:Предприятия (64-bit) для DEB-based Linux-систем
Переходим в терминал и вводим команду:
dpkg -l | grep 1c-enterprise
Получаем список установленной версии
1c-enterprise83-common-8.3.16-xxxx amd64 1C:Enterprise 8.3 common components1c-enterprise83-server-8.3.16-xxxx amd64 1C:Enterprise 8.3 server for Linux1c-enterprise83-ws-8.3.16-xxxx amd64 1C:Enterpise 8.3 Web-services components for Linux
Теперь удаляем эти пакеты
sudo dpkg -r 1c-enterprise83-common-8.3.16-xxxx 1c-enterprise83-server-8.3.16-xxxx 1c-enterprise83-ws-8.3.16-xxxx
Копируем скачанный архив на сервер deb64_x_x_xx_xxxx.tar.gz, распаковываем и переходим в каталог:
tar - zxvf deb64_x_x_xx_xxxx.tar.gz
cd deb64_x_x_xx_xxxx
-nls пакеты я игнорирую и удаляю, затем выполняем команду
dpkg -i *.deb
Сервер 1с обновлён. С версии 8.3.18 нет скриптов автозапуска, см. эту статью.