Главной проблемой восточного полигона считается Cеверомуйский хребет, на преодоление которого были потрачены средства сравнимые со всей стройкой БАМа, однако недавние открытие ученых ставит под вопрос ближайшее решение этой проблемы. Текущие планы РЖД включают строительство второго тоннеля параллельно уже имеющемуся, чтобы расшить основное узкое место БАМа, однако как выяснилось в том месте проходит активный тектонический разлом, и более разумно строить дорогу поверх хребта, что отодвигает сроки завершения модернизации БАМа и не смотря на все расходы многократно уменьшит его пропускную способность. Решение проблемы может быть строительство обхода. Еще с советских времен планировалось построить железную дорогу до города Ленск, откуда грузы далее могли доставляться автотранспортом по Якутии. Но время вносит свои коррективы, сейчас автомобильные дороги развиваются гораздо интенсивнее железных. И гораздо быстрей появится круглогодичная федеральная трасса Вилюй, причем в Якутии настаивают