Покинув Тессию, Шепард м команда получают еще одно сообщение, которое будет зависеть от ситуации с кроганами.
Пропавший патруль
Если кроганами правит Рекс, и генофаг был излечен, с капитаном свяжется Рекс и сообщит, что в скоплении Нинма пропал один из его патрулей, который он послал разведать ситуацию в траверсе.
Прибыв на место, Шепард обнаруживает тела кроганов, похожие на те, которые были в лаборатории "Цербера". Также в пещеру ведет кровавый след, оставленный кем-то тяжело раненым. Пройдя по следу, капитан обнаруживает разведчика кроганов.
Когда Шепард предлагает ему панацелин, тот отказывается, говоря, что панацелин ему уже не поможет. Из разговора становится ясно, что патруль столкнулся с гнездом рахни. Передовой отряд впал в кровавую ярость и ринулся в бой, где и погиб. Другие же стали страдать от головной боли и голосов в голове. В результате они напали на него и их пришлось убить, но сам разведчик получил тяжелые ранения деформирующими патронами.
Пройдя еще дальше, капитан обнаруживает еще одно гнездо рахни, только больше тех, что видел прежде. Повсюду находятся коконы и сети, некоторые проходы перекрыты обломками, похожими на фрагменты Жнеца. В одном из залом на отряд нападают рахни. Сначала это будут обычные солдаты, но в конце на свет выйдет племенной воин.
Разобравшись, с нападавшими, капитан находит устройство Жнецов и уничтожает его, после чего обломок, перегораживающий проход, уходит вниз, открывая путь дальше. Пробившись через ряды рахни, отряд обнаруживает королеву рахни (или производителя, если она была убита).
Королева, как и кварианцы на Раннохе и матриархи азари сильно аугментирована имплантами Жнецов. Через тела кроганов она говорит, что ее свел с ума диссонанс и маслянистые тени, пришедшие вместе с ним. Они заставили ее вернуться сюда и заняться производством. Королева говорит, что еще какое-то время сможет сопротивляться шуму, но ее дети уже потеряны. Перед Шепардом стоит выбор: освободить ее (решение отступника) или убить (решение героя).
Сигнал бедствия
Если генофаг не был излечен, а кроганами правит Рекс, мы получим сигнал SOS с Тучанки. Родной мир кроганов осаждают Жнецы, лагеря многих кланов погибли. Рекс готовит свой клан к отлету, но воздух контролируют Жнецы, поэтому нужно обеспечить безопасный отлет.
Капитану нужно зачистить три точки вокруг лагеря, откуда ведут обстрел опустошители. Кроме них самих точку охраняют налетчики и каннибалы. На третьей точки есть еще и тварь. Когда капитан полностью разберется с артиллерией, появится сборщик и начнет обстрел.
Когда будет покончено и с авиацией, Рекс подтвердит готовность к отлету. У капитана останется от пяти до десяти минут, прежде, чем появятся Жнецы.
Немезида
Данный вариант будет доступен, если генофаг был вылечен, но кроганами правит Рив.
С капитаном свяжется Киррахе либо другой офицер ГОР и сообщит, что кроганы готовят новое восстание. Воевать сразу на три фронта галактика не осилит, поэтому нужно будет решить вопрос окончательно, обезглавив готовящееся восстание. Помогать вызовется один из спутников (в порядке убывания приоритетности: Гаррус, Эшли, Джеймс, Кайден). Нужно будет промаркировать цель, чтобы снайпер смог убрать ее.
Незаметно пробравшись к позиции, изучаем лагерь Урднотов.
Повсюду находятся патрули. Если попасться одному из них на глаза, поднимется тревога. Это означает, что не только придется пробиваться к цели с боем, но и также то, что снайперу придется искать цель самостоятельно. Это приведет к его раскрытию и гибели.
Если удалось занять позицию, подсвечиваем Рива. Метким выстрелом снайпер убиваем Рива и запускается таймер для эвакуации. Если же проникновение раскрыто, то запустится таймер (больший по длительности), в течение которого нужно будет убить Рива и эвакуироваться с планеты.