Особая страница в служебно-боевой деятельности внутренних войск связана с аварией на Чернобыльской АЭС.
26 апреля 1986 г. произошел взрыв четвертого блока Чернобыльской АЭС, охраняемой военнослужащими внутренних войск.
В результате взрыва произошло разрушение защитной оболочки объекта, выброс радиоактивного облака, и возник пожар на территории АЭС. Личный состав войсковой комендатуры, поднятый по тревоге, действовал организованно и смело.
Выполняя решения правительства страны о ликвидации последствий аварии на Чернобыльской АЭС, командование внутренних войск осуществило ряд мероприятий по дезактивации территории и сооружений станции, ее охране, изоляции района аварии и поддержанию надлежащего общественного порядка на прилегающей территории.
Помимо охраны территории Чернобыльской АЭС, на которой произошла авария, личый состав войск был привлечен к охране 30-километровой зоны отчуждения. Неоднократно в районе ликвидации последствий аварии работал начальник внутренних войск генерал армии И.К. Яковлев, который на месте изучал обстановку, определял конкретные задачи личному составу войск.
Внутренним войскам впервые пришлось выполнять задачи при такого рода чрезвычайном происшествии. Это потребовало принятия неординарных решений и проведения в короткие сроки большого объема работ по перевозке войск, размещению их в районах служебно-боевого применения, организации службы, инженерно-технического оборудования рубежей охраны и всестороннего материально-технического обеспечения.
Активная и целенаправленная работа командования внутренних войск обеспечила высокую организованность воинских частей и подразделений, несущих боевую службу, твердый воинский порядок, крепкую дисциплину, здоровую морально-психологическую обстановку в воинских коллективах, повседневную служебно-боевую активность войсковых нарядов и всего личного состава войск.
За проявленное мужество и самоотверженность в ходе ликвидации последствий аварии на Чернобыльской АЭС Указом Президиума Верховного Совета СССР 276 военнослужащих внутренних войск были награждены орденами и медалями.