Когда «Вавилон 5» был продлен на второй сезон, стало ясно, что необходимы некоторые изменения. Сюжетная линия, компьютерная графика, многие персонажи и актеры получили множество положительных отзывов. Второй сезон начинается с внезапного назначения командира Синклера на Минбар в качестве посла. На замену ему приходит капитан Джон Шеридан, что вызывает споры, поскольку некоторые минбарцы ненавидят Шеридана за то, что он уничтожил минбарский флагман во время войны между Землей и Минбаром произошедшей 10 лет назад, «трусливой» тактикой (Шеридан использовал ядерные мины и поддельный сигнал бедствия). В то же время станция находится в кризисе: президент Земного Альянса Луис Сантьяго мертв, начальник службы безопасности Гарибальди находится в коме, его подстрелили, когда он утверждал, что кто-то хотел смерти президента. Посол Нарна Г'Кар пропал, а посол Минбара Деленн находится в каком-то коконе. «У вас здесь интересное место», - считает Шеридан. Сезон 2 показывает переход Галактики от ранее