На берегу Большого Субатского озера расположился один из самых маленьких городов Латвии — Субате. Первые письменные упоминания о городе относятся к середине 16 века. Официально годом основания Субате считается 1570 год.
Название города согласно легенде произошло от имени вождя племени, проживавшего здесь — Субатиса. Изначально название было Суббат.
В середине 17-го века в жизни суботчан происходят изменения в жизни. Владельцы Субате переходят из лютеранской веры в католическую и «записывают» всех жителей в католиков. У многих жителей это вызывает недовольство и они переселяются на восточный берег озера, который принадлежал лютеранам. Так образуется Новое Субате. Через некоторое время возникает что-то подобное соревнованию имений друг с другом. От этого оба только выигрывают.
В 1682 году в Новом Субате открывается новая школа. Школа была частной и проработала 233 года, вплоть до Первой мировой войны. В этой школе учились дети со всей округи.
В 1685 году завершилось строительство деревянной лютеранской церкви.
Почти через 100 лет, в 1773 году на противоположном берегу построено здание католической церкви. Примерно в это же время лютеране строят себе новую каменную церковь. Оба эти храма и сегодня можно видеть по разные стороны озера. Но так как они не имеют высоких башен, издалека их увидеть сложно.
К концу 19-го века Субате в результате политических событий становится обычным местечком, потеряв магдебургское право. К этому времени в Старом и Новом Субате было 12 улиц 298 строений. В 1894 году оба Субате объединяют.
Не обошла стороной Субате и революция. В 1906 году на главной площади произошла стычка, в которой был убит городовой. В убийстве обвинили рабочего, приехавшего из Риги к родителям. Его посадили в сарай, переделанный в тюрьму. Местный житель, который уже был, как говорится, «на крючке» у жандармерии навестил арестованного. Его тоже арестовали и посадили в тюрьму. Ночью их расстреляли, выведя за пределы Субате. Таким образом, 3 человека стали жертвами революции 1905 года в Субате.
К началу Первой мировой войны в Субате проживало 2700 человек. Ко времени ее окончания население сократилось почти наполовину. После февральской революции Субате вновь предоставлено право города.
В 1919 году Субате снова разделено на 2 части. Одну занимают литовские войска, другую — латышские. Литовские солдаты находятся в Субате до 1921 года.
После всех пережитых войн жизнь в Субате начала налаживаться. Восстановлена русско-латышская начальная школа, начали действовать еврейская и литовская начальные школы. В августе 1921 года открывает свои двери Субатская средняя школа, которая была единственной в Илукстском уезде. Так получилось, что после Первой мировой войны Илуксте был практически полностью разрушен и центром уезда временно стал Субате.
В 1931 году, когда Илуксте отстроили заново, среднюю школу перевели из Субате.
В период Латвийской республики город жил бедно и не развивался. Доходы жителей были мизерными и облагать налогами было нечего. Граница с Литвой закрылась и город оказался «на отшибе». Население состояло в основном из евреев, были также русские, литовцы, немцы, латыши и поляки. В 1935 году в Субате жили 1489 человека.
В июне 1940 года с Субате входит Красная армия. В следующем году в городе вновь оказываются немцы и находятся здесь до 1944 года.
В послевоенный период облик города не сильно изменился. В советское время построено несколько кирпичных трехэтажных домов, организованы колхозы. В городе открылась обувная фабрика, была больница и даже свой роддом.
Во время Латвийской республики было организовано автобусное движение между Субате и Даугавпилсом. Автобус ходил один раз в сутки. В советское время автобусы чаще посещали этот город.
Сегодня Субате обычный провинциальные городок. Зимой здесь, тихо, спокойно, уютно. С приходом тепла, ближе к лету, город оживает, приезжают дачники, родственники, становится многолюднее. В городе имеется детский сад, дом культуры, основная латышская школа, магазины, два пансионата – один для пожилых людей, а второй центр – для обслуживания инвалидов, почта, парикмахерская, баня, прачечная.