Обзор-сравнение игры с серией Dead Space можно почитать здесь:
2320 год. Человечество активно осваивает Солнечную систему, колонизируя её планеты и спутники. На спутнике Юпитера, Европе, террористическая группировка "Внешний путь" под предводительством Дани Накамуры устраивает очередную атаку при помощи загадочного биооружия.
Пилоты грузового космического судна "Харон", приятели Джейкоб Ли и Макс Барроу, по заказу Объединённой Юпитерианской компании перевозят некий груз со спутника-тюрьмы Каллисто на Европу. Макс обеспокоен атаками и подозрительным грузом, но Джейкоб решает не вдаваться в лишние подробности из-за очень хорошей оплаты.
По отбытию с Каллисто в грузовой отсек проникает отряд "Внешнего пути", возглавляемый лично Дани Накамурой. Им нужен перевозимый груз.
Чтобы избавиться от террористов, Джейкобу приходится разгерметизировать отсек.
Это приводит к аварии: корабль терпит крушение обратно на Каллисто. Макс погибает.
За Джейкобом и выжившей Дани прибывает отряд тюремной охраны под предводительством капитана службы безопасности Леона Ферриса. К удивлению Джейкоба, арестовывают их обоих.
Их доставляют в тюрьму строгого режима "Чёрное железо", начальником которой является Дункан Коул. В виде голограммы он выступает перед заключёнными, толкая пространные речи.
В тюрьме доктор Кейтлин Малер имплантирует заключённым устройство МОР, позволяющее отслеживать состояние организма.
Когда Джейкоб приходит в себя в тюремной камере, вокруг царит хаос. Камера открыта, что позволяет Джейкобу её покинуть.
Другой заключённый, Элайас Портер, предлагает Джейкобу сотрудничество, чтобы совместно бежать со спутника.
Джейкоб отправляется в диспетчерскую, чтобы отпереть камеру Элайаса. Там он становится свидетелем потасовки между заключёнными, которые нападают и на него, вынуждая с ними разобраться.
Один из заключённых внезапно мутирует в жуткое существо и агрессивно атакует Джейкоба. Некоторые из заключённых становятся монстрами, потерявшими рассудок, и у Джейкоба не остаётся иного выбора, кроме как с ними разбираться.
Освобождённый Элайас направляет Джейкоба к смотровой вышке, где они должны встретиться. Роботы охраны убивают заключённых вне зависимости от того, заражены они или нет.
На вышке находится капитан Феррис, отдающий службе охраны приказ уничтожать всё живое. Заметив Джейкоба, он атакует его с помощью телекинетического устройства GRP.
Джейкобу удаётся натравить на Ферриса мутантов, и капитан погибает.
Джейкоб встречается с Элайасом, который наконец посвящает его в план побега. Покинуть спутник можно только на корабле, и поскольку Джейкоб является пилотом, то сможет им управлять. Среди заключённых Элайас нашёл также хакера, который сможет взломать сеть и вызвать корабль с орбиты, однако этого хакера держат в изоляторе строгого режима, откуда его придётся вызволять.
Освобождённым хакером оказывается никто иная, как Накамура. Узнав Джейкоба, она отказывается помогать им с Элайасом и решает выбираться в одиночку.
Разделённые Джейкоб и Элайас вынуждены двигаться поодиночке. Их конечная цель - ангар. Тем временем монстры мутируют в новые, более сильные формы.
Джейкоб и Элайас воссоединяются в жилом куполе, где надевают защитные костюмы, чтобы добраться до ангара по поверхности. В этот момент появляется выживший капитан Феррис, который раньше времени открывает шлюз, вызывая разгерметизацию. Беглецов выбрасывает тягой.
Придя в себя, Джейкоб идёт сквозь метель и по сигналу аварийного маячка находит Элайаса, который умирает из-за повреждений скафандра.
На сигнал маячка прибывает также Дани, захватившая снегоходный транспорт. Она вырезает из шеи Элайаса устройство МОР, чтобы обладать его сведениями о колонии.
Джейкоб уговаривает Дани объединиться, поскольку он ей нужен в качестве пилота.
Однако прежде, чем отправиться к ангару, Дани везёт их к разбившемуся "Харону" Джейкоба.
Она уверена, что перевозчик причастен к доставке биооружия на Европу. Оказывается, что атаки - дело вовсе не рук "Внешнего пути". Дани уверена, что за ними стоит Юпитерианская компания. Однако на борту "Харона" обнаруживается только груз медикаментов, свидетельствующий о том, что Джейкоб не имеет к происходящему отношения.
Они отправляются к ангару, где Дани вызывает судно, однако начальник Коул сбивает его.
Спасаясь от обломков, Джейкоб и Дани падают с большой высоты, и оказываются в заброшенной колонии "Аркас", над которой затем была построена тюрьма.
Дани хочет вернуться в "Чёрное железо" и получить ответы на все вопросы: чем на самом деле является биооружие и как с этим связан начальник тюрьмы.
Они вынужденно разделяются по причине того, что Джейкоб проваливается в ещё более глубокие помещения. Там он встречает древних мутантов-биофагов, ослепших от долгой жизни в темноте.
Когда Джейкоб находит Дани, он застаёт её подключённой к МОР одного из охранников, что позволяет ей посматривать чужие воспоминания.
Ей удаётся узнать, что 75 лет назад в "Аркас" произошла та же вспышка вируса, что сейчас - в "Чёрном железе". ОЮК уничтожила всё население колонии, чтобы не допустить распространения заражения. Однако, некоторые из шахтёров спаслись и мутировали в биофагов.
Ища выход на поверхность, Дани и Джейкоб находят лабораторию, в которой им проводит экскурсию голограмматическая запись доктора Малер. Она рассказывает, что 75 лет назад с "Аркас" поступил сигнал бедствия. Вспышка вируса была вызвана патогеном, представляющим собой форму ускоренной эволюции. С ним принялись экспериментировать, ставя опыты на людях. Тюрьму "Чёрное железо" построили специально для того, чтобы обеспечить стабильный приток подопытных.
Джейкоб находит останки некоего огромного существа, найденного шахтёрам и убитого охраной. Внутри существа были обнаружены тысячи личинок, которые и являются источником патогена.
После обнаружения, образцы первичных возбудителей были доставлены в центральную лабораторию на Европе. Эксперименты привели к массовым заражениям среди населения. Действуя, как эволюционный ускоритель, патоген в качестве побочного эффекта лишал заражённых разума, и они становились просто агрессивными тварями, атакующими всё живое. Исключением стал лишь некий "нулевой пациент", сумевший под воздействием патогена сохранить разум.
Джейкоб обнаруживает один из тех контейнеров, которые он перевозил, и обнаруживает, что у него есть двойное дно, где под медикаментами спрятаны капсулы с образцами личинок.
На бой с Джейкобом выходит Феррис, мутировавший в биофага.
Джейкобу удаётся от него сбежать, но на Дани нападает паразит, который заражает её патогеном.
Дани хочет совершить самоубийство, но Джейкоб убеждает её попробовать всё исправить. Они доберутся до Коула и попробуют найти средство от вируса.
Дани находит сигнал Коула в командной вышке. В этот момент на Джейкоба нападает робот охраны, который оглушает его и возвращает в камеру.
Когда Джейкоб приходит в себя, с ним связывается доктор Малер. Дани находится у неё, и по утверждениям доктора, её можно вылечить. Малер пытается убедить Джейкоба в своих добрых намерениях, и приводит его к себе.
От Малер Джейкоб узнаёт, что Коул состоит в древней секте, пытающейся форсировать эволюцию человечества. После вспышки патогена в "Аркас", единственный сохранивший разум "нулевой пациент" был убит.
В ходе т.н. Протокола "Каллисто" Коул пытается воспроизвести в "Чёрном железе" те же условия вспышки, которые были в "Аркас", чтобы воссоздать нового альфу, сохранившего разум. Ключевой составляющей антидота для исцеления Дани является чистый образец ДНК альфы.
Джейкоб хочет получить ответы на все вопросы, и тогда Малер синхронизирует его МОР с устройством Дани для передачи памяти. Из памяти Дани он узнаёт, что на Европе она потеряла сестру, ставшую жертвой вспышки, а ОЮК затем подделала запись, чтобы обвинить в атаке "Внешний путь".
Джейкоб, наконец, осознаёт свою причастность к вспышкам на Европе: не задавая лишних вопросов, он доставил груз с образцами личинок.
Джейкоб добирается до командой вышки и находит там Коула, установившего связь с другими членами секты.
Он раскрывает свои мотивы: по мнению секты, будущее человечества лежит в космосе, но человеческое тело слишком несовершенно. Поэтому и нужна форсированная эволюция - чтобы быстрее подготовить человеческий вид к новым возможностям.
Чтобы продемонстрировать превосходство нового вида перед человеком, Коул натравливает на Джейкоба Ферриса, оказавшегося тем самым альфой, сохранившим разум после заражения.
Во время схватки Феррис мутирует в новую, более сильную форму.
Несмотря на это, Джейкобу удаётся его одолеть и взять его образец. Коул убеждает Джейкоба отдать образец ему и эвакуироваться с Каллисто в спасательной капсуле. В этот момент появляется Дани. Она стреляет в Коула, но тот оказывается голограммой.
Джейкоб же не принимает предложение начальника и вместо этого вводит антидот Дани, исцеляя её. Коул этим недоволен, однако утверждает, что собранные данные всё равно выведут Протокол на новый уровень.
Он запускает самоуничтожение колонии, Дани и Джейкоб бегут к спасательным капсулам. Выясняется, что капсула всего одна. Джейкоб сажает в неё Дани и остаётся в гибнущем комплексе, считая, что должен заплатить за свои ошибки.
Синхронизация между МОР Дани и Джейкоба работает в обе стороны, и Дани получает доступ к его воспоминаниям. Кроме того, от него она получила образец личинки, что даёт ей возможность доказать вину ОЮК во всём произошедшем.
Тем временем с уже приготовившимся к смерти Джейкобом связывается доктор Малер, которая приостановила процесс самоуничтожения. Она говорит, что они могут помочь друг другу, если будут действовать сообща.
Разговор прерывает выживший Феррис, который нападает на Джейкоба. На этом игра заканчивается.
