В настоящее время известно, что развитие депрессии и вообще регуляция аффективной сферы зависит от активности определенных структур мозга : медиального и дорсолатерального префронтального кортекса а также орбитофронтального кортекса , поясной извилины , лимбической системы ( амигдала, гиппокамп, парагиппокамп, перегородка, гипоталамус, лимбический таламус, островок) и связанного с ней кортекса переднего височного поля
Предполгается, что депрессия возникает от нарушение функционирования взаимосвязей между префронтальным кортексом и лимбической областью. Эффект электросудорожной терапии некоторые авторы сегодня объясняют ее воздействием на префронтальный кортекс.
Исследования показали, что частая транскраниальная магнитная стимуляция коры префронтальной области может инициировать позитивный терапевтический эффект , направленный на улучшение взаимосвязи между этой зоной и лимбической системой.
Методы нейровизуализации показали, что транскраниальная магнитная стимуляция префронтального кортекса оказывает регулирующее влияние на активность нейронов , принимающих участие в регуляции настроения ( цингулярная извилина, орбитофронтальный кортекс и гиппокамп).
На сегордня не выявлено существенных различий между эффективностью транскраниальной магнитной стимуляцией и электросудорожной терапией , однако, первый метод значительно лучше переносится пациентами, чем второй, не требует предварительной анестезии , а также вызывает меньше побочных эффектов , в частности, в плане негативного влияния на когнитивную сферу.
Совместное назначение транкраниальной магнитной стимуляции и антидепрессантов более эффективно ( быстрота наступления эффекта и его стойкость ) , чем изолированная терапия каждым из этих способов ( Dannon et.al., 2002).