Согласно «ЭСБЕ», селение Толстой-Юрт (Старый Юрт) было основано в 1705 году. В составе Российской империи относилось к Грозненскому отделу Терской области.
До 1 августа 1934 года селение Старый Юрт входило в состав Надтеречный район.
1 августа 1934 года ВЦИК постановил «образовать в Чечено-Ингушской автономной области новый Грозненский район с центром в городе Грозном, включив в его границы: в) селение Старый Юрт Надтеречного района».
С 1944 по 1958 года, в период депортации чеченцев и ингушей и упразднения Чечено-Ингушской АССР, село носило название — Толстово.
В 1977 году Указом президиума ВС РСФСР было переименовано в село Толстой-Юрт.
Село известно как место рождения и деятельности мусульманского проповедника Докку (Абдул-Азиза) Шаптукаева[12][13], устазом (духовным учителем) которого был Элах Мулла, тот же, что и у Дени Арсанова. Также село Тостой-Юрт известно как место рождения российского политического деятеля Руслана Хасбулатова и как место гибели Аслана Масхадова.
Во время чеченского конфликта в 1990-х годах, Толстой-Юрт часто упоминался в сводках боевых действий в СМИ.