Как и многие памятники мировой значимости, Аркаим был открыт случайно. В 1987 году вопрос о строительстве водохранилища на реке Большая Караганка был практически решён. Археологи проводили рядовое в таких случаях изучение безынтересной местности в речной долине и неожиданно наткнулись на следы укрепленного поселения индоариев эпохи бронзы (рубеж III - II тыс. до н.э.). Территорию вот-вот должны были затопить, но памятник отстояли, и с 1991 года здесь стартовали раскопки под руководством Г. Здановича, самого авторитетного исследователя Аркаима.
Поселение было названо по названию одной из сопок, которая располагается в 4 км к югу от поселения. Топоним «Аркаим» происходит от тюркского «хребет», «спина», «основа».
На сегодня он остаётся наиболее изученным протогородом из так называемой "Страны городов" - комплекса из 20 аналогичных поселений того же периода, раскинувшихся на 350 км (минимальное расстояние между двумя объектами - 40 км) по южно-уральской степи. Аландское, Куйсак, Берсуат