Опознавательными знаками Арсенала и в настоящее время являются две башни из красного кирпича, между которыми протекает широкий канал. Комплекс изначально имел два входа - по суше для рабочих и морские врата для судов. В XV веке были построены главные ворота Арсенала (порта Манья) по проекту архитектора Я. Беллини в стиле ренессанс.