Сегодня Нью-Йорк Таймз описывает результаты нового научного исследования - компьютерного моделирования возможного распространения нового вируса. Результаты очень интересны. Анализ показал, что в штате Вашингтон и в Италии первые подтвержденные случаи заболевания не привели к последующим вспышкам заражения. Эпидемии возникли позже. Новое компьютерное моделирование предлагает поменять представление о сроках распространения коронавируса.
Как показывает исследование, по всему миру коронавирус появлялся несколько раз, не вызывая вспышек безудержного распространения. В этих первых подтвержденных случаях передача вируса была незначительной или вообще отсутствовала, и первоначальный вирус просто вымер.
Но более поздние мутации действительно привели к нынешней пандемии, включая вирус, который был завезен в США приблизительно в феврале, а в Италию - в начале или в середине февраля. Затем европейский вирус перескочил в Нью-Йорк примерно в конце февраля.
Авторы компьютерной модели утверждают, что относительно позднее возникновение вспышки - примерно через две недели после того, как президент Трамп запретил поездки в США из Китая, - означает, что более ранние превентивные меры могли бы спасти больше жизней в этой стране.
Первые подтвержденные коронавирусные инфекции в Европе и в Соединенных Штатах, обнаруженные в январе, не вызвали последовавших эпидемий, согласно тщательному анализу сотен вирусных геномов.
Например, в то время как президент Трамп часто утверждал, что запрет на поездки из Китая предотвратил ухудшение эпидемии, новые данные свидетельствуют о том, что вирус, который вызвал эпидемию в штате Вашингтон, был привезен примерно через две недели после введения запрета в США для граждан из Китая (2 февраля).
Авторы также утверждают, что относительно позднее возникновение вспышки означает, что больше жизней можно было бы спасти с помощью ранних действий, таких как тестирование и отслеживание контактов.
Новый анализ - не окончательный. Научное понимание коронавируса развивается почти ежедневно, и этот тип исследований моделирует целый ряд возможных результатов, но не дает пока полную определенность.
Ряд вирусологов заявили, что новый отчет убедительно исключает связь между первыми подтвержденными случаями заболевания и последующими вспышками.
"Эта статья ясно показывает, что этого не произошло”, - говорит Кристиан Андерсен, компьютерный биолог из Исследовательского института Скриппса в Сан-Диего в интервью Нью-Йорк Таймз.
Майкл Воробей, эволюционный биолог из Университета Аризоны, и его коллеги опубликовали предварительную версию своего исследования в интернете в субботу. Она еще не была опубликована ни в каком научном журнале.
Вирусы развивают генетические мутации примерно с одинаковой скоростью по мере своего размножения. Ученые могут использовать эти мутации для реконструкции движения вируса в популяции и оценки того, когда началась вспышка эпидемии в регионе.
Первым подтвержденным случаем коронавируса в США стал человек, который прилетел из Китая в Международный аэропорт Сиэтл-Такома 15 января. Исследователи выделили геном его вируса, который стал известен как WA1.
Мужчина был госпитализирован в изолятор и выздоровел. 24 февраля у подростка также были обнаружены положительные результаты на коронавирус.
Тревор Бедфорд, генетик из Вашингтонского университета и Центра изучения рака имени Фреда Хатчинсона, и его коллеги обнаружили, что этот вирусный геном был почти идентичен WA1, за исключением двух новых мутаций. Они назвали второй вирус WA2.
Встревожившись, он и его коллеги пришли к выводу, что наиболее вероятным объяснением этой незначительной разницы было то, что WA1 циркулировал в штате Вашингтон в течение шести недель, приобретая мутации по пути.
Подразумевалось, что в штате могут быть сотни людей, уже инфицированных, что создавало почву для резкого роста случаев заболевания. Чиновники отреагировали на эту новость агрессивными мерами, которые эксперты общественного здравоохранения приписывают сдерживанию распространения болезни.
Поначалу доктор Воробей находил работу доктора Бедфорда и его коллег "чертовски убедительной." Но по прошествии времени, - сказал он в интервью, - что-то на задворках моего сознания начало ускользать.”
Вирусы гораздо более подвержены генетическим мутациям, чем другие живые существа. Но по мере распространения вирусов новый коронавирус становится все более медлительным - гораздо более стабильным, чем вирусы гриппа, например.
Доктору казалось маловероятным, чтобы с коронавирусом произошло две мутации всего за несколько недель.
По мере распространения эпидемии доктор Бедфорд и его коллеги исследовали сотни геномов коронавирусов из штата Вашингтон. Ни один из геномов не соответствовал WA1. Все они соответствовали мутациям, обнаруженным в WA2.
Доктор Воробей и его коллеги решили продолжить исследование. Они повторили возникновение вируса тысячи раз на компьютере, работающем с программой, которая имитирует то, что мы знаем до сих пор о том, как новый коронавирус распространяется и мутирует.
Когда исследователи смоделировали WA1 как источник вспышки болезни в штате Вашингтон, компьютер не смог воспроизвести вирусные мутации, обнаруженные там в последующие недели. Было почти невозможно, чтобы WA1 привел к вспышке заболевания, решили ученые.
Гораздо более вероятно, что группа вирусов WA2 была завезена в Вашингтон из Китая примерно в феврале, 13-го числа, и началась эпидемия.
Это случилось примерно через две недели после того, как г-н Трамп запретил въезд туристам из Китая. Однако, согласно анализу газеты "Нью-Йорк Таймс", за два месяца после введения этих ограничений в США побывало около 40 000 человек.
Яна, 20-летняя женщина, приехавшая из Китая в Германию, встретилась со своими коллегами в компании по поставке автомобилей. Она не знала, что больна, и заразила мужчину на встрече.
Ученые собрали генетическую сигнатуру этого вируса и назвали его BavPat1. Этот вирус распространился на 16 человек в компании — но затем исчез.
В конце февраля в Италии произошла первая вспышка заболевания в Европе. Коронавирусы там были генетически очень близки к BavPat1, как обнаружили ученые, что привело к подозрениям, что вирус в Италию завез немецкий турист.
Новое исследование показало, что во всем мире коронавирус появлялся несколько раз, не вызывая внезапных вспышек. В этих случаях передача вируса была незначительной или вообще отсутствовала, и вирус просто вымирал.
Для доктора Уробея время, предшествовавшее началу пандемии в Соединенных Штатах, было упущенной возможностью, когда тестирование и отслеживание контактов могли бы иметь большое значение.
“Были недели, прежде чем вирус действительно разыгрался, - говорит он в интервью Нью-Йорк Таймз. “Это действительно заставляет меня думать, что наши ошибки гораздо более значительны.”
Это исследование представляет собой "очень тщательный и строгий анализ того, что мы можем и чего не можем сказать о вспышках эпидемии в США и Европе на основе геномных данных”, - говорит Эдвард Холмс, вирусолог из Университета Сиднея, который не принимал участия в исследовании.
“На мой взгляд, все это подчеркивает проблемы, связанные с получением выводов о внедрении и распространении вирусов на основе ограниченных данных.”
Этот новый взгляд на историю пандемии - именно то, как должна работать наука, утверждает доктор Андерсен из Scripps Research. Ученые ищут наилучшую интерпретацию данных — и затем продолжают исследования.
Но для общественности может быть тревожно наблюдать изменение научного мнения в реальном времени.
“Мы должны жить с этой неопределенностью", - говорит доктор Андерсен.
По материалам Нью-Йорк Таймз