Экспозиция музея, насчитывающая свыше полутора тысяч экспонатов, знакомит посетителей с двухсотлетней историей университета. Основной раздел посвящен науке — исследованиям и открытиям, научным школам, принесшим университету всемирное признание. большое внимание уделено выдающимся ученым, знаменитым выпускникам, участию университета в общественно-политической жизни страны.
В структуре музея, кроме основной экспозиции, размещенной в бывшей университетской церкви — мемориальный комплекс, созданный под руководством доктора исторических наук профессора Г.Н. Вульфсона: аудитория юридического факультета и актовый зал, где воспроизведены интерьеры второй половины XIX века, зал Н.И. Лобачевского и выставочный зал, где представлен постоянный раздел «линия научной обороны» — о вкладе ученых академии наук СССР в победу в Великой отечественной войне в период эвакуации академических институтов в Казань (1941–1943гг.).
Темы экскурсий:
- Обзорная экскурсия; Н. И. Лобачевский — ученый, ректор, гражданин;
- И. М. Симонов — участник 1-ой кругосветной экспедиции;
- Казанская химическая школа. Выдающийся ученый — А.М. Бутлеров;
- Е.К. Завойский. Открытие ЭПР;
- Казанский университет в общественно-политической жизни;
- Питомцы Казанского университета — деятели литературы и искусства;
- Лев Толстой и Казань;
- «Линия научной обороны».
