В традиционном фармацевтическом производстве мониторинг уровня микробиологического загрязнения воздуха проводится с помощью метода питательных сред (чашки Петри). Этот метод позволяет узнать об уровне микробиологического загрязнения только пост-фактум. На данный момент уже выпускаются приборы, способные подсчитывать микроорганизмы в режиме реального времени, используя метод флуоресцентного свечения микроорганизмов.