Правительство, которое вновь возглавил граф Арран, не смогло справиться с ситуацией и было вынуждено обратиться за помощью к Франции. 31 июля 1547 года французский экспедиционный корпус выбил протестантов из Сент-Эндрюса, и участники мятежа были арестованы - среди них, как уде упоминалось выше, был и Джон Нокс. В ответ на это в Шотландию вторглись английские войска герцога Сомерсета, которые в сентябре 1547 года разгромили шотландцев в битве при Пинки. Английские гарнизоны были расквартированы в наиболее важных крепостях на востоке страны. Невозможность сплочения католических и протестантских сил Шотландии заставила Марию де Гиз и графа Аррана снова обратиться за помощью к Франции. Положение было весьма благоприятным: в 1547 году на французский престол взошёл король Генрих II, настроенный на возобновление войны с Англией с целью возвращения Булони и Кале. Помимо этого, при французском дворе лидирующие позиции заняли представители семьи Гизов, братья Марии. 7 июля 1548 года был заключен