Всем привет. Я обещал вернуться к теме коронавируса не только в рамках разбора мифов диссидентов, но и если произойдёт что-то новое, что необходимо объяснить. Сегодня как раз подобное произошло. Великобритания сообщила о распространении в стране нового штамма SARS-CoV2, названного «20A.EU1», который, по данным вирусологов, является более заразным, чем обычные штаммы. На новостные сайты в этой ситуации особо надеяться не стоит, информация там зачастую очень общая и пресная, поэтому я нашёл научную работу про этот новый штамм и решил сделать свою статью.
В чём заключается мутация 20A.EU1?
На данный момент в мире известно более 200 000 различных геномов SARS-CoV 2, и это не удивительно, ведь вирусы, как и любые организмы на Земле подвергаются различным воздействиям, а значит они будут меняются, но зачастую подобные изменения на течение заболевания не влияют, разве что на эффективность вакцин, и то по-разному. Некоторые мутации вообще никак не влияют на эффективность, а некоторые сильно.
Ещё летом 2020 года, предположительно в Испании (да, это теперь испанский COVID), появился штамм 20A.EU1, который, как и его потомок 20A.EU2, имеет мутацию в пепломере («шипе», с помощью которого вирус попадает в клетку). С тех пор эти штаммы активно распространились по Европе. Ниже приведены данные филогенетического анализа их распространения по странам:
Данная мутация не играет важной роли в связывании с рецепторами клеток, но может оказать влияние на стабильность белка, став «фундаментом» для дальнейших мутаций.
Для оценки эффективности проникновения в клетки, учёные использовали лентивирусные частицы (Ретровирусы с долгим течением заболевания, самым ярким представителем которого является ВИЧ), заменили их пепломеры на мутантную пепломеру коронавируса, заразили разные контрольные группы (не людей, разумеется) штаммами с мутировавшим белком и не мутировавшим и проверили титры антител. В результате, хотя антител к мутировавшему штамму было больше, статистически эта разница значимой не была, что ставит под сомнение его большую способность проникать в клетки. Но подобные изменения не всегда отражаются в таких системах, чтобы это окончательно подтвердить или опровергнуть, учёные, вопреки заявлениям креационистов, что все прогрессивные учёные давно уже антиэволюционисты, проанализировали эпидемиологические и эволюционные данные.
Эволюционный и эпидемиологический анализ
В качестве эволюционных данных учёные взяли по нескольку наиболее распространённых штаммов из стран Европы, в частности, учёным был интересен анализ именно последовательностей 20A.EU1, и проанализировали их в соответствии с данными о мерах, принятых правительством, а именно их интересовал бескарантинный проезд между странами:
После этого сосредоточились именно на Испании, как на месте возможного появления данной мутации и обнаружили, что самые ранние штаммы, связанные со вспышками на северо-востоке страны, перешли с сельскохозяйственных рабочих на местное население, а потом распространились по всему миру. После распространения появились и другие штаммы, связанные с 20A.EU1, в основном в Англии, а поскольку второй по частоте причиной распространения стали поездки из Англии в Испанию, туристы привезли уже мутировавший штамм 20A.EU1. Такой вот «обмен». На диаграмме ниже — данные анализа мутаций штаммов связанных с 20A.EU1:
Более поздние передачи вируса связанны уже с другими штаммами, привезёнными из Испании.
Далее идёт описание распространения штаммов по странам, которое мы видели на первом рисунке, из чего можно сделать вывод о степени заразности вируса.
Выводы по заразности и распространению
Наиболее активное распространение «испанского COVIDа» пришлось именно на момент открытия странами границ и стабилизировалось после введения новых Lockdown (строгих карантинных мер с полным закрытием границ и ограничениями на перемещения). Из этого следует, что причинной активного распространения 20A.EU1 стали туристы.
В то же время увеличение числа заражений связанно с появлением штаммов, связанных с 20A.EU1, но в таких странах, как Бельгия, Франция, Чешская Республика распространение штаммов, связанных с 20A.EU1, очень слабое. При этом число заражений сопоставимо с тем, что происходит в странах, где частота распространения данных штаммов выше, что позволяет предположить, что новый штамм не связан с увеличением числа заражений.
Впрочем, эти данные не опровергают более высокую заразность, ибо распространение заболеваний может быть связанно с несколькими факторами. И работает это в обе стороны. С одной стороны, действительно, возможно новый штамм и не при чём, а все это лишь иные эпидемиологические факторы. С другой, неблагоприятные эпидемиологические факторы могут присутствовать и в странах с низким распространением штаммов 20A.EU1, подгоняя количество заражений под страны с высоким распространением данных штаммов. Также не стоит исключать и положительные эпидемические факторы, которые могут снижать количество заболевших в обеих странах. Проще говоря, связь данного штамма с увеличением заразности пока не доказана.
Также, за данными штаммами ведётся не наблюдения в части данных о тяжести и летальности. Увеличились ли они, уменьшились или остались без изменений, пока нет вообще никаких данных.
Заключение
На основании этой работы можно сделать несколько выводов:
1. Карантин необходим, иначе подобный «обмен» мутировавшими штаммами станет частым явлением, что впоследствии увеличит генетическое разнообразие SARS-CoV-2 и снизит эффективность вакцин.
2. Доказательств увлечения заразности пока нет.
3. Данных о летальности и тяжести нет.
Проще говоря пока можно не беспокоиться, похоже, что это самая обычная рядовая мутация, никак не отражающаяся на свойствах вируса. Но и расслабляться тоже не стоит, так как дальнейшие мутации могут влиять на эффективность вакцин, что в свою очередь затянет пандемию, поэтому надо постараться снизить количество заражений и распространение штаммов по миру.
Спасибо за прочтение, не болейте.
P.S. Если нашли в статье ошибку
Если вы нашли в статье ошибку (неверно назван термин или описан процесс), сообщите в комментарии, информация будет проверена и исправлена.