Первая выставка прошла в ноябре 1951 года
История музея началась с 1904 года, когда при Курганском отделе Московского сельскохозяйственного общества появился сельскохозяйственный музей. Это был первый музей в Кургане. В 1920 году организуется музей местного края, а затем окружной музей.
С 1930 года музей размещался в Народном доме, но в 1937 году здание Народного дома горело, и почти все коллекции погибли. 15 июня 1943 года исполком Курганского областного совета принял решение о создании при отделе народного образования областного краеведческого музея. Музею передается помещение Александровской церкви, куда он и переезжает в 1949 году. В ноябре 1951 года открывается первая экспозиция теперь уже областного музея.
Музей имел три отдела: природы, истории, советского общества. С 1957 года при музее стал работать планетарий. В 1960-е годы фонды музея пополнялись материалами археологических, естественно — научных и историко-бытовых экспедиций. Под руководством кандидата исторических наук К. В. Сальникова проводятся раскопки Царёва Кургана. Собирали материалы о первых коммунах, коллективизации, об участниках гражданской и Великой Отечественной войн. В музей поступают клады монет, разнообразная утварь и одежда, в результате музейные экспозиции дополняются новыми материалами.
Ежегодно выставки посещали около 200 тысяч человек, организуются экскурсии, лекции, массовые мероприятия. В 1991 году храм возвращают верующим, а музею передается здание бывшего Дома политпросвещения, где он и располагается в настоящее время.
