Найти в Дзене
Биоинформатика

Биоинформатика

Биоинформатика - это наука на стыке биологии, математики и IT, которая помогает разгадывать сложные загадки жизни с помощью компьютерных технологий. В этой подборке вы найдете статьи о том, как современные алгоритмы и искусственный интеллект используются для анализа ДНК.
подборка · 2 материала
2 месяца назад
FST, PCA и qpAdm как методы анализа моего генетического образца
Продолжая свои эксперименты с генетическими данными, я наконец-то освоил инструменты AdmixTools и применил их для расчёта FST, анализа главных компонент (PCA) и моделирования древних примесей с помощью qpAdm. Эти методы позволяют рассматривать мой генетический образец не как набор чисел, а как часть общей картины генетического разнообразия, где каждая популяция занимает своё место, а степень их близости можно оценить количественно и визуально. AdmixTools - это программный пакет, разработанный для...
5 месяцев назад
Мой эксперимент с VCF и импьютацией
Я - энтузиаст, а не профессиональный биоинформатик, но мне всегда было интересно, как устроены генетические сервисы «изнутри». Всё началось со стандартной операции: я скачал VCF‑файл из личного кабинета Генотек, конвертировал его в формат 23andMe V5 через DNA Kit Studio и загрузил полученный файл на GEDmatch. Но столкнулся с неожиданной ошибкой: Status: Matchy - too many matches GEDmatch не объясняет, что именно значит «слишком много совпадений» - это не баг с понятной ошибкой, а некое «статус‑сообщение», после которого система просто отказывает в выдаче результатов...