Генетика

Популяция цедрел душистых произошла от двух генетически разных предков, а положение других видов цедрел теперь под вопросом. Цедрелы - род цветковых растений семейства Мелиевые, который произрастает на территории в Новом свете от юга Мексики до севера Аргентины. Новое исследование выдвигает модель, согласно которой цедрела душистая (Cedrela odorata) должна быть разделена на 2 вида: мезоамериканскую и южноамериканскую формы, так как все представители происходят не от 1 предка, а от 2. Кроме того, C. angustifolia и C. montana надо объединить в совместный вид. По словам ученых, они подготовили 168 образцов цедрел и воспользовались возможностями ADMIXTURE и составили дерево ядерных видов. Подсчеты показывают, что род цедрел диверсифицировался в Новом свете за последние 19 миллионов лет. Оригинал

Методика показала, что пробелы в ДНК несут много информации и их нельзя игнорировать Первый шаг, выполняемый аналитиками ДНК - выравнивание известных последовательностей, дабы сравнить их друг с другом. Из-за замен и делеций нуклеотидов (конструкционных элементов ДНК) могут образовываться пробелы, и при выравнивании они превращаются в прерывания столбцов. Недавно было выяснено, что нельзя говорить о пробелах как о недостатке, а вместо этого необходимо расценивать их как дополнительный источник знаний. Исторически ученые полагают, что места разрывов никак не зависят от самого генома и появляются в случайных точках. Команда исследователей из Государственного универсистета Северной Каролины провела простой тест. Они проанализировали 1390 наборов выравниваний и обнаружили, что ⅔ наборов имели схожие места пробелов. Это говорит о проблематичности нынешнего подхода к выравниванию, и, возможно, о его несостоятельности. А ведь целые эволюционные деревья уже построены с применением этого метода! «Простого решения не существует, но, надеюсь, это исследование поможет нам помнить о потенциальных ловушках. Нам нужно знать о проблемах с традиционными статистическими методами и работать над их устранением». – Тэ-Кун Сео, главный научный сотрудник Корейского института полярных исследований и соавтор исследования.