В 1930-е годы Ватухины переехали в Орджоникидзе (ныне Владикавказ), откуда в 1940 году Федор был призван в Красную Армию, в рядах которой встретил начало Великой Отечественной войны.15-й Регион (Северная Осетия)
Перед батальоном Ватухина была поставлена задача – форсировать реку Южный Буг и захватить плацдарм для дальнейшего наступления.15-й Регион (Северная Осетия)
Несмотря на применение танков, самоходных орудий, минометов и авиации, противнику не удалось задушить наступление батальона, плацдарм был удержан.15-й Регион (Северная Осетия)
Награжден был Федор Ватухин орденами Красного Знамени, Суворова III ст. (2 раза), Отечественной войны II ст. Награждение двумя «полководческими» орденами – Суворова III ст. является редким случаем для младшего командирского состава Красной Армии.15-й Регион (Северная Осетия)