Российские ученые создали базу данных, которая объединяет все известные пептиды (полимеры из аминокислот), выделенные из ядов животных и действующие на калиевые каналы. Эти вещества способны связываться со своей молекулярной мишенью в мембране клеток и влиять на их работу. База данных позволит ученым ускорить поиск подходящих пептидов для разработки новых лекарств и упростит фундаментальные исследования калиевых каналов. Работа выполнена при поддержке гранта Президентской программы исследовательских проектов РНФ и опубликована в журнале Scientific Data. Калиевые каналы — это белки, находящиеся в мембране клеток и служащие своеобразными порами, через которые могут проходить только ионы калия. Калиевые каналы обнаружены практически у всех живых организмов. Существуют различные вещества, способные связываться с калиевыми каналами, их называют лигандами. Например, это могут быть ионы металлов, низкомолекулярные соединения и пептиды. Они могут затыкать пору канала или модифицировать его, в результате чего калиевый ток блокируется. "Сейчас во всем мире ведется поиск и описание различных веществ, которые действуют на калиевые каналы, чтобы впоследствии на их основе разработать высокоэффективные препараты. Очень часто подобные вещества выделяют из лекарственных растений или из яда животных", — комментирует Алексей Кузьменков, кандидат химических наук, научный сотрудник лаборатории молекулярных инструментов для нейробиологии Института биоорганической химии имени академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН. Разработанная база данных Kalium 2.0 объединяет все пептиды-лиганды калиевых каналов, выделенные из ядов скорпионов, змей, пауков, морских беспозвоночных, пчел и многих других организмов. Взаимодействие пользователя с базой данных сосредоточено вокруг основной таблицы с информацией о лигандах калиевых каналов, отсортированных по таким параметрам, как группы организмов-источников полипептида, названия видов этих организмов, семейства полипептидов и некоторые другие.Газета.Ru