С распространением NGS ученые отошли от методов FISH и MERSFISH и стали чаще секвенировать РНК из образцов, преимущественно фиксированных при помощи мгновенной заморозки (FF).PCR.news
Ученые анализирование выделение РНК из FF-тканей, хранившихся два года при температуре -80°C, и FFPE-тканей, фиксированных 4% формалином и хранившихся заключенными в парафин при 4°C в течение двух лет.PCR.news
При анализе экспрессии генов ученые обнаружили, что FF и FFPE-образцы расходятся на две четкие группы в анализе главных компонент (PCA) вне зависимости от метода выделения.PCR.news
Выравнивание полученных прочтений для данных генов показало значительное снижение количества выравненных фрагментов после отметки в 500 нуклеотидов от 3’ конца гена для FFPE-образцов.PCR.news