Сравнив сигналы доступности хроматина между группами предшественников В-клеток, ученые выявили примерно 42 344 геномных локуса, которые демонстрируют тенденцию к повышению или снижению хроматина для предшественников В-клеток.PCR.news
Далее авторы сравнили доступные участки хроматина между B-ALL и Pro-B клетками с помощью DESeq2 на 217 240 объединенных пиках доступности хроматина B-ALL и выявили 42 661 дифференциально доступных участка хроматина (DAS).PCR.news
Дифференциальная оценка связывания показала, что семейство транскрипционных факторов AP-1 обладает более высоким уровнем связывания в образцах пациентов с B-ALL по сравнению с нормальными клетками Pro-B.PCR.news
Также исследователи охарактеризовали профиль транскрипционных факторов для 810 транскрипционных мотивов во всех сайтах доступа к хроматину в клетках B-ALL, и выявили от 4,3 до 5,4 млн связанных мотивов в каждом подтипе.PCR.news