Протеогеномное профилирование рака: данные и инструменты

Ученые из консорциума по клинической протеомике рака (Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium, CPTAC) составили базу данных, включающую информацию по молекулярным исследованиям более 1000 опухолей из 10 когорт раковых заболеваний.PCR.news
Для облегчения работы с базами CPTAC авторы опубликовали статью, в которой привели характеристику данных, использованные методы анализа и рекомендованные инструменты для обработки.PCR.news
Исследователи из CPRAC работали с большим количеством алгоритмов, однако данные, вошедшие в итоговый набор, были обработаны с применением пайплайнов, разработанных в Институте Броудов и Университете Вашингтона в Сент-Луисе.PCR.news
Исследователи отмечают, что различные типы данных (например, мРНК и белковые данные) несут информацию о различных аспектах происходящих в клетке процессах.PCR.news