Моя генеалогия
От FASTQ до генеалогических сервисов: полная инструкция по работе с WGS Extract
⚠️ Важно. Материалы этого блога - личный опыт и практика энтузиаста, актуальные на момент публикации; они не являются инструкцией к обязательному действию, юридической консультацией или предложением услуг по передаче биоматериала либо генетических данных за рубеж. С 1 сентября 2026 года в России действуют новые правила передачи генетических данных человека за пределы страны (ФЗ №43-ФЗ от 20.02.2026, ПП РФ №750 от 15.06.2026). Если вы планируете повторить что-либо из описанного здесь, пожалуйста, самостоятельно сверьтесь с действующим законодательством - практика могла измениться...
Как загрузить исходные данные в FamilyTreeDNA и разблокировать все функции (Unlock)
⚠️ Важно. Материалы этого блога - личный опыт и практика энтузиаста, актуальные на момент публикации; они не являются инструкцией к обязательному действию, юридической консультацией или предложением услуг по передаче биоматериала либо генетических данных за рубеж. С 1 сентября 2026 года в России действуют новые правила передачи генетических данных человека за пределы страны (ФЗ №43-ФЗ от 20.02.2026, ПП РФ №750 от 15.06.2026). Если вы планируете повторить что-либо из описанного здесь, пожалуйста, самостоятельно сверьтесь с действующим законодательством - практика могла измениться...
Оценка популяционной близости на основе IBD
Я решил изучить ещё один способ анализа своего генетического образца - через модельную оценку генетического сходства с представителями различных современных популяций. Для этого я использовал инструмент PLINK, который позволяет вычислить показатель PI_HAT. Этот коэффициент оценивает долю генома, вероятно идентичную по происхождению (Identity-by-Descent, IBD), на основе наблюдаемого сходства генотипов (Identity-by-State, IBS). Иными словами, PI_HAT позволяет количественно оценить степень генетической близости между отдельными индивидами...
FST, PCA и qpAdm как методы анализа моего генетического образца
Продолжая свои эксперименты с генетическими данными, я наконец-то освоил инструменты AdmixTools и применил их для расчёта FST, анализа главных компонент (PCA) и моделирования древних примесей с помощью qpAdm. Эти методы позволяют рассматривать мой генетический образец не как набор чисел, а как часть общей картины генетического разнообразия, где каждая популяция занимает своё место, а степень их близости можно оценить количественно и визуально. AdmixTools - это программный пакет, разработанный для...
Мой эксперимент с VCF и импьютацией
⚠️ Важно. Материалы этого блога - личный опыт и практика энтузиаста, актуальные на момент публикации; они не являются инструкцией к обязательному действию, юридической консультацией или предложением услуг по передаче биоматериала либо генетических данных за рубеж. С 1 сентября 2026 года в России действуют новые правила передачи генетических данных человека за пределы страны (ФЗ №43-ФЗ от 20.02.2026, ПП РФ №750 от 15.06.2026). Если вы планируете повторить что-либо из описанного здесь, пожалуйста, самостоятельно сверьтесь с действующим законодательством - практика могла измениться...

