Музей истории купечества расположен во внутреннем кольце Гостиного двора, где сейчас открыто общественное пространство "Двор Гостинки". Двухэтажное здание, в котором разместились музейные залы, было построено как дом Комитета по управлению Гостиным двором в конце 1860-х годов по проекту инженера-архитектора Константина Алексеевича Кузьмина. У входа в музей — две сияющие золотом вывески и небольшая звонница домового храма Серафима Вырицкого. Помещение храма соседствует с музейными залами на втором этаже...

"О богатствах Гостиного двора, заключенных в его многочисленных лавках и кладовых — ни в сказке сказать, ни пером описать! Без сомнения, по ценности сосредоточенных в нем разнообразных товаров... и по сумме оборотов петербургский Гостиный двор... не имеет себе равных по всей России...," — такую характеристику петербургскому Гостиному двору дал во второй половине XIX века писатель и историк быта Владимир Осипович Михневич. Кое-что из продававшегося в разные годы в гостинодворских лавках и магазинах можно увидеть в витринах на втором этаже Музея купечества...