В 2011 году 23 марта «Зенит-Ижевск» получил аккредитацию в Федерации спорта России и право выступать на профессиональной футбольной арене. С 2011 года клуб выступает во Втором дивизионе. Выступления клуба за последние 11 лет В выступлениях за Кубок России клубу не удавалось пройти выше 1/16 этапа. В 2021/22 сезоне команда вылетела на этапе 1/256, в 2022/23 – не прошла групповой отбор, уступив ФК «Тюмень». Во Втором дивизионе команда демонстрирует нестабильные результаты. ФК «Зенит-Ижевск» стал серебряным финалистом ФНЛ-2 в сезонах: 2014/15; 2015/16; 2016/17...

Футбольный клуб «Зенит-Ижевск» может перейти из второй лиги в третью. Поклонники этого вида спорта негодуют, и это понятно – столица Удмуртии не представлена ни в одной профессиональной лиге России. Министр спорта Денис Парахин успокоил болельщиков и объяснил ситуацию. Переход команды в третью лигу в первую очередь связан с низкой эффективностью клуба. Футболисты редко приносят победу родному ФК, трибуны полупустые, а внебюджетных средств привлекается только 5%. Поэтому региональные власти решили перезагрузить футбол в Удмуртии...