В 2011 году 23 марта «Зенит-Ижевск» получил аккредитацию в Федерации спорта России и право выступать на профессиональной футбольной арене. С 2011 года клуб выступает во Втором дивизионе. Выступления клуба за последние 11 лет В выступлениях за Кубок России клубу не удавалось пройти выше 1/16 этапа. В 2021/22 сезоне команда вылетела на этапе 1/256, в 2022/23 – не прошла групповой отбор, уступив ФК «Тюмень». Во Втором дивизионе команда демонстрирует нестабильные результаты. ФК «Зенит-Ижевск» стал серебряным финалистом ФНЛ-2 в сезонах: 2014/15; 2015/16; 2016/17...

ФК «Зенит-Ижевск» лишается профессионального статуса и не будет в следующем сезоне выступать в первенстве Футбольной национальной лиги-2. Так называется третий по значению дивизион отечественного футбола. Причиной «перезагрузки» стали неудовлетворительные спортивные результаты. С таким заявлением выступил в пятницу 7 июля министр спорта Удмуртской Республики Денис Парахин. Он сообщил, что клуб продолжит свою работу в качестве автономной некоммерческой организации, но футбольная команда станет любительской и будет выступать в более низкой соответствующей лиге...