Заниматься водным поло Борис Попов начал в детской школе ЦСК ВМФ в родной Москве, но всю карьеру провел в команде МГУ. В ее составе в 1972 году он стал чемпионом СССР. «Во всесоюзном чемпионате команда МГУ выделялась интеллектом, - рассказал Попов в одном из интервью корреспонденту «Спорт уик-энда». - По подбору игроков мы уступали не только ЦСК ВМФ, куда призывали лучших ватерполистов со всей страны, но и другим конкурентам. Только за счет грамотной, можно даже сказать - умной игры все время были в призерах, а в 1972-м стали чемпионами»...

Двукратный чемпион России в составе «Рубина» Алексей Попов высказался о матче за Суперкубок России между «Зенитом» и «Спартаком» (1:1, 4:2 пен). Перед серий пенальти главный судья матча Евгений Буланов принял решение не проводить жеребьёвку с определением ворот, в которые будут наноситься удары. «Тут можно говорить только компетентности судьи, он, видимо, действовал по регламенту. Но двойные стандарты были всегда. Всегда везёт тем, у кого больше денег. Видимо, и здесь кто-то может быть равнее, у кого больше связей...