Кун родился в 1988 году в Кильмесе в провинции Буэнос-Айреса. Агуэро начал играть в футбол с самого раннего детства, начиная с Лома-Алегре с 6 лет, к 9 годам перешел в академию Индепендьенте, где выступал до 2003. С 2003 года выступал за основную команду Индепендьенте, а с 2004 года выступал и за юниорскую сборную Аргентины до 2005, а с 2006 вызывался в молодежку Аргентины. Агуэро с самого детства был на веду и являлся лидером всех команд. В 2006 Кун так проявил себя, что уже в свои 18 лет его...
Всё знают,что Агуэро имеет приставку Кун к имени.В этих трёх буквах замешаны Япония,Родители и сложны характер Серхио. В детстве Агуэро обожал японски мультик "Шаловливый Кум-Кум".Родственники и друзья в шутку сравнивали Серхио с главным героем. По началу Серхио не очень оценил такое прозвище,но вскоре уже привык к нему и оно стало для него почти родным. Все в семье забыли что было как-то по другому и приставка прижилась. Так получилось что парень из Аниме дал прозвище Будущей Аргентинской звезде...