Кубок России 1995/1996 стал первым во многом. Это дебютный сезон для титульных спонсоров. Первой компаний, вложившая деньги в соревнование, стал автокомплектующий гигант “Magna”. Впервые финал Кубка переехал. До этого трофей разыгрывался в “Лужниках”, а в этом сезоне на стадионе “Динамо”. В сезоне Кубка России 1995/1996 обладателем трофея стал московский “Локомотив”. Для “железнодорожников” это стала первая победа в этом в соревновании. Отметим, что с этого розыгрыша "Локомотив" стал регулярно побеждать в Кубке...

Третий по счёту Кубок России стартовал со стадии 1/256 финала. С этой стадии вступали в борьбу клубы Второй лиги. Из интересных имён, начавших поход за Кубок с первого раунда, стоит отметить тульский Арсенал, оренбургский Газовик (ныне ФК Оренбург), грозненский Терек (ныне Ахмат) и казанский Рубин...