Сезон 1999 оказался для Илья последним в составе "Спартака". Хотя поначалу ничего не предвещало такого печального финала. С возвращением в начале года в сборную Олега Романцева, вернулся туда и Цымбаларь. После Евро-96 Илья за два с половиной сезона провел в сборной всего несколько матчей - то травмы не позволяли, то тренеры делали ставку на других игроков. Но с возвращением на пост наставника Олега Иваныча, Илья опять стал одним из основных кандидатов. Сыграл два отборочных матча против Армении и Андорры, но беды опять подкрались неожиданно...