В 1999 году в Первой лиге, как и до этого, соревновались 22 команды. По итогам чемпионата две лучшие получали путевки в Высший дивизион, а пять худших отправлялись во Второй. Матчи первого тура прошли 1 апреля. По две победы на старте на своих полях одержали Анжи, Амкар и Газовик-Газпром. После третьего тура ни у одной команды не было абсолютного результата. По итогам первых четырех по 10 очков набрать смогли Сокол и Торпедо-ЗИЛ, на одно меньше было у Факела. После 6-го тура начала образовываться группа лидеров, но пока что это все было предварительно, свой отпечаток мог наложить и календарь...

Как известно, первенство Второго дивизиона закончено досрочно. Победителем в группе "Запад" признан идущий на первом месте московский клуб "Велес". Он получил право играть в ФНЛ.