В 1993 году команды Второй лиги играли в семи зональных турнирах. Никто не поднимался в Первую лигу(!). Такого не было до этого и не будет после. По четыре лучшие команды каждой из 1-5 зон, 3 команды из шестой и все из седьмой оставались во Второй Лиге, которая будет сильно уменьшена в 1994 году. Большинство переходило в создаваемую Третью лигу. На Дальнем Востоке не создавалась еще одна зона Третьей лиги в будущем, поэтому из седьмой зоны никто не вылетал, но были такие, кто в 1993 году закончил, хотя последнее качается всех зон...

В 1993 году чемпионат России проходил без разделения на этапы. 18 команд соревновались в двухкруговом турнире. По его итогам две худшие команды отправлялись в Первую лигу, а команды, занявшие 3 места перед ними, в переходном турнире с победителями трех зон первой лиги выявляли трех, кто сыграет в Высшей лиге 1994 года. Таким образом, число участников Высшей лиги уменьшалось до 16 команд. Также разыгрывались 3 путевки в Кубок УЕФА сезона 1994/95 гг. Первыми открыли сезон московские армейцы. В матче ¼ финала Кубка России 18 февраля они со счетом 3:0 победили Светотехнику из Саранска...