Какие методы используются для генетического анализа микобиоты?
Evann E. Hilt, Patricia Ferrieri. Технологии секвенирования нового поколения в диагностической микробиологии (полный текст статьи).
За последние несколько десятилетий использование технологий секвенирования следующего поколения (NGS) в клинической диагностике расширилось. Технологии NGS (next generation sequencing) позволяют проводить массовое параллельное секвенирование миллионов фрагментов ДНК с высокой пропускной способностью. В области диагностики генетических заболеваний и рака эти технологии стали золотым стандартом диагностики. Только в последнее десятилетие, когда эти технологии NGS стали более доступными, их использование в лаборатории клинической микробиологии стало реальностью...
Диагностика и эпиднадзор за неонатальными инфекциями с помощью метагеномного секвенирования нового поколения (аннотация)
Инфекционные заболевания являются важной причиной заболеваемости и летальности в популяции новорожденных. В 2019 году в мире регистрировалось 17 смертей на 100 живорожденных и 6700 неонатальных смертей ежедневно (Gu et al., 2019). В общей сложности 48% случаев смерти новорожденных старше 7 дней могут быть связаны с микробными инфекциями, которые являются основной причиной смерти в этот период. Обычные микробиологические тесты обычно имеют длительное время выполнения и низкую чувствительность. Золотым стандартом идентификации микроорганизмов является культура...