Время Simple очень простое, но только до тех пор, пока дело не касается вопросов. Здесь-то и начинается путаница. А чтобы распутать этот клубок, нужно усвоить один факт: вопросы в английском задаются с помощью инверсии. Это значит, что в вопросе меняется прямой порядок слов. Примеры я специально приведу с другими временами. Прямой порядок слов в Present Continuous: You are going to Sochi. Ты едешь в Сочи. Порядок слов в вопросе: Are you going to Sochi? Прямой порядок слов в Present Perfect: She has been there. Она побывала там. Порядок слов в вопросе: Has she been there? Инверсия...
Очень часто в живой речи на английском вы можете встретить употребление вспомогательного глагола, например, в Present Simple или Past Simple в утвердительных предложениях - то есть там, где он обычно не стоит, так как используется для образования отрицаний или вопросов. Вот пример такой ситуации: I did buy what she asked, but she still nagged me. Я купил то, что она просила, но она всё равно доставала меня. Это делается для усиления, выделения, подчёркивания действия: "я купил то, что она просила"...