Prototype 2 — продолжение приключенческого экшен-слэшера с видом от третьего лица в открытом мире. В игре вы примерите роль нового героя Джеймса Хеллера. Некогда семейный человек, который по вине Алекса, выпустившего на улицы Нью-Йорка вирус, лишился всего, что ему было так дорого в жизни — семьи. После того как Алекс заразил Джеймса, последний стал обладателем сверх способностей и решил отомстить, своему создателю за всё хорошее...

Продолжим описание сюжетной завязки игры. Ученые сообщают протагонисту еще одну "радостную" новость - теперь он является собственностью корпорации, так сказать, подопытным кроликом для будущих экспериментов с вирусом. Такая неприятная перспектива вовсе не пришлась по душе главному герою, который сразу решил выбраться из заключения. Сокрушив стекло собственной камеры, Джеймс пулей выбежал из лаборатории, но в одном из городских переулков ему вдруг встретился (кто бы вы думали) Алекс Мерсер. На этот...