Может быть, вы обращали внимание на различие падежных форм местоимений третьего лица? Почему начальное он при склонении превращается в его, ему, им, о нем? В их фонемном составе совсем ничего нет от начального он? Такая же картина и с местоимениями женского и среднего рода. Чтобы понять, почему так, нужно погрузиться в историю языка. Дело в том, что в общеславянском языке не было местоимений третьего лица. Нам сейчас это довольно трудно представить, однако это так. Местоимения первого и второго лица (я, мы, ты, вы + ее и ва, указывающие на пару) были, а местоимений третьего лица не было...