HTTPS-прокси не видит трафик приложения по одной из четырёх причин: приложение игнорирует системный прокси и ходит в сеть напрямую, не доверяет пользовательскому сертификату, сверяет сертификат сервера со своим эталоном (certificate pinning) или шлёт данные по UDP через QUIC. Причина определяется по симптому в логе прокси, и у каждой своё лечение. Типичная ситуация на проекте с обменом данными. Торговый агент пишет в Telegram: заказ в приложении оформился, статус «Отправлен», а в 1С документа нет...