Понятие онтологии первоначально философское, согласно Вике: Онтология (новолат. ontologia от др.-греч. ὤν род. п. ὄντος — сущее, то, что существует и λόγος — учение, наука): «Генная онтология» - (Gene Ontology, или GO) — биоинформатический проект, посвящённый созданию унифицированной терминологии для аннотации генов и генных продуктов. Целью проекта является составление аннотаций генов и продуктов, разработка инструментов для работы с базой данных проекта, а также для анализа новых экспериментальных данных, в частности, анализ представленности функциональных групп генов...

Онтология - довольно глубокое и сложное понятие, но мы постараемся объяснить его наиболее просто. Это направление в философии, которое занимается изучением бытия и всего существующего. Ведь каждый из нас хотя бы раз задавался вопросом: "Что такое реальность?". Онтология пытается дать на этот вопрос ответ. Она исследует, что именно существует в мире, какова природа этого существования и что можно считать реальным. Вспомним обыденные ситуации. Когда мы говорим: "Это стол", или "Вон там дерево", мы уже оперируем определенными категориями существования...