Покинув Тессию, Шепард м команда получают еще одно сообщение, которое будет зависеть от ситуации с кроганами. Пропавший патруль Если кроганами правит Рекс, и генофаг был излечен, с капитаном свяжется Рекс и сообщит, что в скоплении Нинма пропал один из его патрулей, который он послал разведать ситуацию в траверсе. Прибыв на место, Шепард обнаруживает тела кроганов, похожие на те, которые были в лаборатории "Цербера". Также в пещеру ведет кровавый след, оставленный кем-то тяжело раненым. Пройдя по следу, капитан обнаруживает разведчика кроганов...

Высадившись на станцию "Цербера", передовой отряд начинает прокладывать путь к сердцу станции. На пути будут встречаться войска Призрака, включающие все боевые единицы организации, в том числе адъютантов. Попутно капитан узнает, что симптомы, схожие с одурманиванием мучили главу организации уже не один десяток лет. В консоли также содержится информация о событиях на Шаньси и Палавене, контакте с Сареном и его братом, а также создании подставной фирмы "Кор-Хислоп". Пройдя далее, отряд попадает в...