Вы дали агенту IDE полный доступ к проекту, попросили поправить один эндпоинт оплаты, а он снёс папку /migrations. Миграции — это хронологический журнал изменений вашей базы данных. Представьте тетрадь, где записано: «в понедельник мы добавили колонку email», «во вторник удалили поле age». Если эта тетрадь исчезает, база теряет инструкцию, как превратить старую версию в новую. На локальной машине разработчика базу придётся пересобирать с нуля или откатывать бэкапы. В бою [на рабочем сервере] такой промах может уронить сервис сотням пользователей...