Раньше, в те времена, когда знаний о внутреннем строении вещества было маловато, никаких различий между молекулами не замечали. Молекула была молекулой, в понимании мельчайшей частицы вещества. Но сейчас уже есть хорошее понимание того, что дело в общем-то обстоит не совсем так...