Раньше была такая игра "херики и оники". А ещё без стыда говорили слово "похерить", "выхерить", "захерить" и так далее. Никто не стеснялся и не краснел при слове "хер". А всё потому, что раньше была буква "хѣръ" — бабушка нашей "Х" (буква называется "ха", а не "хэ", как некоторые думают). Называлась она так, кстати, от слова "херувим" — это, скажем так, наиболее близкие к Создателю ангелы — а не от того, о чём некоторые могли подумать. Смысл слова "хер" Короче говоря, "хер" использовался в значении "перечеркнуть что-то на бумаге крестом"...
У букв русского алфавита всегда были названия. А - Аз, Б - Буки (отсюда и слово "азбука", кстати), В - Веди, Г - Глагол и пр.
Даже у Ъ, Ы и Ь были названия - ер, еры и ерь (и, кажется, это единственный способ запомнить их порядок в современном алфавите). Сейчас-то мы уже не помним, что Ъ произносился как легкое Ы на конце любого слова, оканчивающегося на согласный. А в болгарском до сих пор Ъ читается почти как Ы.
Но этот пост про хер. Именно так называлась буква Х.
Слово хер не означает ничего, кроме буквы Х. Именно поэтому оно стало использоваться как эвфемизм и заменять слово хуй на том основании, что оно тоже начинается на букву Х...