Поскольку в Unreal Engine не совсем плюсы (подробнее читайте вступление), то и проекты - не совсем проекты. Основным файлом проекта является файл "[project name].uproject" в корне папки проекта. Этот тот файл, с которого движок начинает загрузку проекта. Соответственно он обязателен и должен находиться под системой контролем версии, если вы ее используете. Файл содержит перечень загружаемых плагинов, версию используемого движка и перечень платформ, под которые проект будет собираться. Папка Source Source - исходники вашей игры. В дальнейшем вы (скорее всего) придете к использованию плагинов и исходники переедут в Plugins...
Допустим есть условный пользователь Вовочка, у него есть компьютер и там есть папка документов. Она находится по адресу C:\Пользователи\Вовочка\Документы. На самом деле это виртуальный путь, настоящий путь там будет C:\Users\Вовочка\Documents. У меня папка документов находится по другому адресу: d:\Clouds\YandexDisk!profiles\Fainder\Documents. Зачем так делать, сейчас разберёмся. При установке Windows создаёт папку Users (отображается в Проводнике, как “Пользователи”), внутри неё папку с именем каждого пользователя и уже там внутри находятся все пользовательские файлы...