Слова, как и люди, проживают свою судьбу. Некоторые приходят в гости и остаются насовсем, другие получают новый смысл, третьи уходят в небытие. Устаревшие слова — интереснейший пласт языка. Что такое устаревшие...

Такие похожие слова эти "дерево" и "деревня" - но родственны ли они? Деревня - это разве там, где деревья? Как раз наоборот. Тогда уж стоило бы так называть лес. Но это если не копать вглубь. В аналогичных по образованию словах, например, "зарево", "марево" , "варево" - есть суффикс "-ев-" после корня ("-зар-", "-мар-", "-вар-"). А значит и в случае с деревом есть большая вероятность остаться именно с корнем "-дер-" (ну или "-др-", если вспомнить о варианте "древо"). Первыми словами, на основе которых сформировались языки, скорее всего, были глаголы...