Значение церкви Рождества Богородицы в Перыне исследователи архитектуры Великого Новгорода смогли оценить лишь в середине XX века. Тогда же археологами было открыто место расположения древнего святилища, о котором рассказывали летописи. Урочище Перынь расположено к югу от Великого Новгорода на живописном холме левого берега Волхова, а своё название получило, судя по всему, по святилищу Перуна. Святилище идола Перуна Новгородская летопись свидетельствует, что здесь находился деревянный идол Перуна, который после принятия христианства был в 988 году срублен и сброшен в реку...

Постройка каменной церкви Рождества Богородицы датируется 30-ми годами XIII века. Основу дошедшего до нас здания составляет кладка домонгольского времени – сочетание известняка и тонкого кирпича – плинфы, положенных на известковом растворе, с примесью кирпичной крошки (цемянки)...